王協源博士於1999年獲得美國哈佛大學電腦科學博士學位。2000年加入國立陽明交通大學資訊工程系擔任助理教授，2003 年升為副教授，2009年升為正教授至今。從2021年開始亦擔任國立陽明交通大學產業創新研究學院智能系統研究所合聘教授。從2024年開始，王博士從國立陽明交通大學借調到中央研究院資訊科技創新研究中心擔任智慧物聯網專題中心執行長和研究員。

王協源博士在國立陽明交通大學任教期間擔任過電機資訊學士班主任、資訊科學與工程研究所所長、網路工程研究所所長等職務。於 2012 年獲得中華民國資訊月「傑出資訊人才獎」和「傑出資訊應用及產品獎」、2014 年獲得日本東京理科大學校長獎、2021 年獲得第十九屆有庠科技論文獎「資通訊科技領域」、2023年獲得國立台灣師範大學資訊工程學系傑出系友獎，2024年獲得資策會軟體院前瞻技術獎。從2021年開始, 每年都被史丹佛大學的專家學者根據 Scopus 論文影響力數據，從超過 1,000 萬名科學家中被選為終身科學影響力世界排名前 2% 的頂尖科學家。